Identificati geni candidati per la resistenza all'afide grigio del melo
Un team internazionale di ricercatori dell'Università di Bologna, della FEM di Trento, dell'INRA di Parigi e del SERIDA di Villaviciosa (Spagna) ha identificato 4 geni candidati per la resistenza all'afide grigio del melo.
La cultivar Florina è resistente all'afide grigio e recentemente il locus Dp-fl responsabile della sua resistenza è stato mappato sul gruppo di linkage 8 del genoma del melo. In questo studio, un approccio di walking cromosomico, tecnica che permette di trovare la posizione e la sequenza di un determinato gene su un cromosoma, è stato eseguito utilizzando una libreria Florina di cromosomi artificiali batterici (BAC).
Tale tecnica è iniziata dai marcatori molecolari disponibili strettamente collegati che fiancheggiavano la regione di resistenza. Sono stati eseguiti vari passi per identificare la sequenza minima dei cloni BAC che coprono la regione Dp-fl di entrambi i cromosomi "resistenti" e "sensibili" di Florina. Una regione genomica di circa 279 Kb, che comprendeva il locus di resistenza Dp-fl, è stata completamente sequenziata dalla tecnologia PacBio.
Attraverso lo sviluppo di nuovi marcatori polimorfici, l'intervallo di mappatura attorno al locus della resistenza è stato ridotto a una regione fisica di 95 Kb. L'annotazione di questa sequenza ha portato all'identificazione di quattro geni candidati implicitamente coinvolti nella risposta di resistenza all'afide grigio.
Fonte: M. Dall’Agata, G. Pagliarani, S. Padmarasu, M. Troggio, L. Bianco, E. Dapena, M. Miñarro, S. Aubourg, Y. Lespinasse, C. E. Durel, S. Tartarini, 'Identification of candidate genes at the Dp-fl locus conferring resistance against the rosy apple aphid Dysaphis plantaginea', Febbraio 2018, Tree Genetics & Genomes.